如果有同事被感染了，新冠肺炎阳性了，那么公司是有义务对相关的工作场所工作环境进行终末消毒。如果员工仅仅以不相信公司对工作场所进行了相关的消杀，以为没有消杀干净，那么我不愿意选择继续上班的，这种情形呢公司应当及时的和员工进行沟通，消除员工的担忧。如果员工还是不愿意去上班的话，那么就会构成旷工。如果员工以用人单位没有提供劳动条件来解除劳动合同，要求经济补偿金的话，这种情况呢并不会得到法律的支持。

　　根据相关规定，如果属特殊行业、岗位工作人员，单位需要提供口罩等防疫物资。但是规定并未明确要求所有单位必须向员工发放口罩等防护用品，所以员工不能以用人单位未提供口罩为由拒绝上班。当然，企业出于人文关怀，应该力所能及地为员工身体健康负责。